刺穿表皮、皮质组织，进入维管束，在导管内生长发育。病菌是由下向上扩展，所以，病株萎蔫先从下部叶片开始，以后逐渐向上发展。病菌还能分泌，干扰植株的代谢作用，致使植株中亡。除土壤带菌外，种子也可传带病菌。植物种子带菌为病害的远距离传播（尤其是新小种的传播）以及甜瓜新种植地区的病害发生提供了重要的甚至是初侵染源。土质黏重、地势低洼、排水不良、耕作粗放、根系生长发育不良也容易造成病害发生。
影响植株根系生长的因素往往有利于甜瓜枯萎病的发生。如天气时雨时晴，或久旱后下雨，或量过大，西红柿青枯病怎么防治，次数过多，田间有积水或高温、高湿、土壤偏酸性等都有利于病菌的侵入而加重发病程度。另外，地下害虫和线虫较多造成根系损伤，为病原菌的侵入提供了有利条件。抗病育种：选育优良的抗（耐）病品种，培育无病壮苗。在同一栽培条件下，早熟品种抗甜瓜枯萎病能力明显低于晚熟品种。
依据代谢物质的有无或多少来显示病原菌侵染植物的过程。荧光蛋白标记病原菌结合激光共聚焦扫描显微镜观察可以揭示在亲和与非亲和状况下病原菌侵染过程的组织学和细胞学特征，可以比较病原菌侵染不同抗性种质的差异或不同小种侵染同一种质的差异。但是尚不清楚孢子如何地粘附到植物表面，是被物理的或化学的信号刺激，还是孢子与植物表面存在着非常专化的相互作用，有待进一步的研究。
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