病菌可通过中耕、浇水、农事操作等近距离传播，病残体遇高湿的条件也可长出孢子借气流或风雨传播，从而进行侵染。棉花枯萎病菌的远距离传播，主要是借助于附着在棉花种子上的病菌和带菌的棉籽饼。
棉花枯萎病是典型积年流行病。病害的发生与消长受气候条件、耕作制度、栽培管理及土壤中线虫等因素影响。 [3] 气候条件温度和湿度是影响枯萎病发展的主要因素。通常当土壤温度达20℃左右时，田间棉苗开始发病，其后随着土温的升高，病情逐趋加重，草莓青枯病治疗方法，当达25-30℃时，形成发病高峰。夏季当土温升高到33-35℃时，病害停止发展，秋季随着温度的下降，田间可岀现第二次发病高峰。
轮作：与非瓜类作物实行3-5年的轮作倒茬是防治甜瓜枯萎病的重要农业措施。茬口以选择小麦、豆类、休闲地，其次是棉花、玉米等。此外，采用洋葱和大蒜作为轮作物，可明显减轻甜瓜枯萎病的为害，也可实行水旱轮作，选择中性或微酸性的砂壤土种植。 [2] 加强栽培管理：加强栽培管理是重要的农业防治手段。主要措施包括合理施用磷、钾肥和充分腐熟的肥料；适当中耕，提高土壤透气性，促进根系粗壮，增强抗病力；小水沟灌，适当控制浇水，保持土壤半干湿状态，忌大水漫灌，及时清除田间积水；发现病株及时拔除，收获后清除病残体，减少菌源积累。
病原细菌主要随病株残余组织遗留在田间越冬，在土壤的病残体上营腐生生活能存活14个月以上。在环境条件适宜时，病菌主要借雨水反溅和灌溉水传播，也可通过农事操作、家畜等传播途径，从寄主的根部或茎基部的伤口侵入，入后在维管束内繁殖，向上部蔓延扩展，使维管束变褐腐烂，茎、叶因缺乏水分的正常供应而产生萎蔫。上海、江浙地区番茄青枯病的主要发病盛期在5-10月。年度间梅雨期间多雨或夏秋高温多雨的年份发病重；田块间连作地。地势低洼。排水不良、土质偏酸的田块发病较重；引发病症表现的天气条件为大雨或连阴雨后骤然放晴，气温迅速升高，田间湿度大，发病现象会成片出现。
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